| BEST | WORST |
CONTIG
(bp)
(bp)
CONTIGS
LENGTH
(bp)
(1bp <= len < 10Kbp)
(10Kbp <= len < 100Kbp)
(len >= 100Kbp)
| |||||||||||||||||||
|
| ||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||
| ASSEMBLY | LONGEST CONTIG (bp) |
Nx (Lx) | LENGTH (bp) |
NUM CONTIGS |
SUM LENGTH (bp) |
Contig Length Histogram (1bp <= len < 10Kbp) |
Contig Length Histogram (10Kbp <= len < 100Kbp) |
Contig Length Histogram (len >= 100Kbp) |
|||||||||||
| 4E-metaSPAdes.contigs | 1261692 | N50: | 17370 |
|
1 | 1261692 | |
|
|
||||||||||
| L50: | (900) |
|
120 | 31736947 | |||||||||||||||
| N75: | 3505 |
|
1463 | 66930628 | |||||||||||||||
| L75: | (5786) |
|
17520 | 119251584 | |||||||||||||||
| N90: | 2404 |
|
17520 | 119251584 | |||||||||||||||
| L90: | (12059) |
|
17520 | 119251584 | |||||||||||||||
| 4E-IDBA.contigs | 637224 | N50: | 19385 |
|
0 | 0 | |
|
|
||||||||||
| L50: | (663) |
|
87 | 16577896 | |||||||||||||||
| N75: | 5365 |
|
1344 | 48613915 | |||||||||||||||
| L75: | (2782) |
|
9065 | 78507962 | |||||||||||||||
| N90: | 2915 |
|
9065 | 78507962 | |||||||||||||||
| L90: | (5841) |
|
9065 | 78507962 | |||||||||||||||
| 4E-MEGAHIT-sensitive.assembly | 1137074 | N50: | 11458 |
|
1 | 1137074 | |
|
|
||||||||||
| L50: | (1499) |
|
93 | 23922080 | |||||||||||||||
| N75: | 3389 |
|
1756 | 65822607 | |||||||||||||||
| L75: | (7349) |
|
19947 | 126142406 | |||||||||||||||
| N90: | 2375 |
|
19947 | 126142406 | |||||||||||||||
| L90: | (14141) |
|
19947 | 126142406 | |||||||||||||||
| 4E-MEGAHIT-large.assembly | 1136554 | N50: | 9746 |
|
1 | 1136554 | |
|
|
||||||||||
| L50: | (1725) |
|
92 | 23766975 | |||||||||||||||
| N75: | 3274 |
|
1669 | 61630462 | |||||||||||||||
| L75: | (7958) |
|
20513 | 124346254 | |||||||||||||||
| N90: | 2357 |
|
20513 | 124346254 | |||||||||||||||
| L90: | (14766) |
|
20513 | 124346254 | |||||||||||||||